Sonraí Poiblí don tSláinte

I mí Aibreáin, sheolamar⁠ IS ar son Alzheimer, an chéad chlár de chuid OpenAI Foundation sna hEolaíochtaí Beatha agus i Leigheas Galar. Inniu, táimid ag tabhairt isteach ár ndara clár eolaíochta: Sonraí Poiblí don tSláinte.

Le IS ar son Alzheimer, dírímid ar ghalar amháin a théann i bhfeidhm ar go leor teaghlach agus creidimid gur féidir le IS cabhrú le heolaithe cóireálacha níos fearr a fhorbairt dó. Le Sonraí Poiblí don tSláinte, dírímid ar dhul chun cinn a chumasú ar fud na n-eolaíochtaí beatha agus maidir le go leor galar, trí mhaoiniú a thabhairt chun tacair sonraí eolaíochta ardchaighdeáin a chruthú agus a chaomhnú agus iad a chur ar fáil go forleathan do thaighdeoirí.

Is éard atá i sonraí eolaíochta ná breathnuithe ar an domhan mórthimpeall orainn, an t-ionchur bunúsach don taighde agus don fhionnachtain. I réimsí inar féidir dul chun cinn cinniúnach a fhíorú gan sonraí nua a bhailiú, amhail codanna den mhatamaitic, tá córais IS tar éis tosú le déanaí ag cur⁠ le heolas⁠ nua⁠. Sa bhitheolaíocht, áfach, tá córais IS ag éirí níos cumasaí ar fhaisnéis bhitheolaíoch a anailísiú ar mhórscála agus struchtúr folaithe a aimsiú fiú i bhfianaise neamhiomlán, uaireanta le héifeachtúlacht iontach.

Mar sin féin, measaimid go dtiocfaidh cuid mhór den dul chun cinn atá fós le déanamh maidir le galair a chosc agus a chóireáil as intleacht samhlacha nua a chomhcheangal le tuilleadh breathnuithe ar an domhan—is é sin le rá, tuilleadh sonraí.

D’fhéadfadh sé nach gcruthófaí ná nach gcomhroinnfí choíche roinnt tacar sonraí a mbeadh luach ollmhór poiblí ag baint leo, toisc nach bhfuil dóthain dreasachta ná acmhainne ag aon institiúid aonair chun iad a mhaoiniú. Dá bhrí sin, tá tacaíocht do shonraí poiblí don tsláinte an-oiriúnach do OpenAI Foundation.

Ár ndeontais tosaigh

Ar dtús, táimid ag tacú le breis agus $125 milliún i ndeontais do ghrúpa tosaigh eagraíochtaí neamhbhrabúis agus ollscoileanna, a chuimsíonn go leor sraitheanna sonraí: ó mhóilíní go heipidéimeolaíocht agus eolas rialála.

Seo roinnt samplaí de na tionscadail a bhfuilimid ag tacú leo:

1. Cruthóidh OpenADMET⁠ tacair sonraí oscailte, tagarmharcanna agus comórtais dhallaithe chun a thástáil an féidir samhlacha IS a oiliúint chun a thuar conas a ionsúitear agus a dháiltear móilíní beaga ar fud an choirp, d’fhonn forbairt drugaí a dhéanamh níos intuartha agus ráta teip drugaí nua a laghdú.

   Teipeann ar 90% d’iarrthóirí drugaí i dtrialacha cliniciúla⁠. Is minic gurb é is cúis leis sin ná an deacracht a bhaineann lena thuar conas a ionsófar iad agus a ghluaiseann siad tríd an gcorp—a n-airíonna “ADMET”⁠. D’fhéadfadh dúshláin tuartha gan réiteach mar seo a bheith an-oiriúnach do IS, má chuirtear sonraí ardchaighdeáin leo chun cruinneas thuar na samhlacha éagsúla a bhunú ar fhianaise. Mar shampla, rinne AlphaFold2 claochlú ar thuar struchtúr próitéiní trí shonraí ón Protein Data Bank⁠ a úsáid i gcomórtas a reáchtáil CASP⁠ in aghaidh cineálacha eile samhaltaithe. Tá tuar struchtúr próitéiní comhtháite anois i mórán clár fionnachtana drugaí ar dócha go rachaidh siad chun tairbhe d’othair amach anseo.

   Chun airíonna ADMET iarrthóirí drugaí a thuar níos fearr, forbróidh foireann OpenADMET tacair sonraí ardchaighdeáin ar a mbunófar samhlacha nua tuartha agus reáchtálfaidh siad dúshláin oscailte ar féidir le taighdeoirí ar fud an domhain páirt a ghlacadh iontu.

   

   “Tá fadhbanna uilíocha go smior i bhfionnachtain drugaí nach féidir le haon chuideachta aonair ná saotharlann acadúil ar spéis léi galar ar leith a leigheas réiteach ina haonar,” a dúirt James Fraser, PhD, comhalta de Bhord Rialaithe OpenADMET agus Ollamh agus Cathaoirleach le Bithinnealtóireacht agus Eolaíochtaí Teiripeacha ag UCSF. “Cruthaíodh OpenADMET chun dul i ngleic leis na fadhbanna seo ar bhealach oscailte atá ullamh don mheaisínfhoghlaim. Táimid ar bís go mbeimid in ann an tsraith bhunúsach a chruthú lena gcumasófar do IS forbairt cóireálacha nua a luathú go mór.”

2. Caomhnóidh agus foilseoidh CTD Commons⁠ eolas rialála ó chláir forbartha drugaí ar theip orthu, ionas gur féidir le foirne amach anseo foghlaim ó fhasach a choinnítear faoi cheilt de ghnáth agus cóireálacha éifeachtacha a aimsiú níos tapúla d’othair.

   Is doiciméad é CTD, nó Common Technical Document, ina dtiomsaítear aistear iomlán druga imscrúdaithe—gach rud ó thocsaineolaíocht ainmhithe agus sonraí déantúsaíochta go comhfhreagras leis an FDA, arb é an chuid is úsáidí de, b’fhéidir. Ní bhíonn ach cuid bheag den obair sin le feiceáil i bpáipéir fhoilsithe, áfach.

   Déanfaidh CTD Commons tástáil ar an bhféidearthacht CTDanna a fháil ó chláir drugaí ar theip orthu nó a cuireadh ar leataobh, agus iad a chur ar fáil go hoscailte do chách le haghaidh taighde agus anailíse.

   “Léiríonn gach aighneacht chuig an FDA obair chrua agus íobairtí taighdeoirí, athbhreithneoirí agus rannpháirtithe staidéir. Fiú nuair a theipeann ar na hiarrachtaí sin, níor cheart an fhaisnéis luachmhar a chruthaíonn siad a chur amú,” dar le Josh Morrison, príomheagraí CTD Commons agus Uachtarán 1Day Sooner. “Laghdóidh CTD Commons dúbláil agus costas, agus uasmhéadóidh sé tionchar an taighde chliniciúil.”

3. Bunóidh UNC⁠ an Tionscnamh um Imdhíonteiripe Ghiniúnach, agus cruthóidh sé sonraí poiblí ilmhódacha chun todhchaí a bhaint amach ina bhféadfaidh othair ailse vacsaíní pearsantaithe ailse a fháil go tapa nuair a fhaigheann siad diagnóis.

   Tá vacsaíní ailse “nua-antaigine” an lae inniu ar an mbeagán cógas a dheartar go ríomhaireachtúil do gach othar, trí chill meall a sheicheamhú lena thuar cé na spriocanna a bhaineann go sonrach leis an meall atá ar dhromchla na cille. Ach níl sa seicheamhú sin féin ach tomhas ionaid ar an bhfírinne, mar go bhfuil sé deacair agus costasach spriocanna dhromchla na cille a thomhas go díreach, agus, anuas air sin, a sheiceáil cé chomh láidir agus a imoibríonn córas imdhíonachta an othair do gach ceann de na próitéiní sin.

   Cruthóidh UNC na naisc sin atá in easnamh thar na céadta meall agus roinnt cineálacha éagsúla ailse, rud a chruthóidh ceann de na chéad tacair sonraí oiliúna agus measúnaithe sa réimse seo, le sonraí poiblí dí-aitheanta ar féidir le taighdeoirí ar fud an domhain cur leo.

   “Tá comharthaí éifeachtúlachta cliniciúla ag teacht chun cinn faoi dheireadh ó vacsaíní pearsantaithe ailse, ach tá bearnaí iontu fós a bhféadfadh sé na blianta fada a thógáil iad a líonadh faoi shamhail thraidisiúnta na forbartha teiripí. Is féidir le sonraí ardchaighdeáin cabhrú linn na bearnaí sin a líonadh níos tapúla,” a dúirt Alex Rubinsteyn, PhD, Ollamh Cúnta le Géineolaíocht i Scoil Leighis UNC. “Táimid ar bís an tréimhse seo a ghiorrú agus cabhrú le himdhíonteiripí pearsantaithe a bhíonn éifeachtach go ginearálta a fhíorú.”

   

Ár straitéis tosaigh

Measaimid go mbeidh an chuid seo thar a bheith ábhartha do thaighdeoirí ar spéis leo deiseanna deontais ó OpenAI Foundation amach anseo.

Tá i bhfad níos mó sonraí eolaíochta ann arbh fhiú iad a bhailiú ná mar a d’fhéadfadh aon mhaoinitheoir amháin tacú leo. Dá bhrí sin, theastaigh uainn tuilleadh a roinnt anseo leis an bpobal taighde faoi na cineálacha sonraí ar dóigh linn gur féidir le tacaíocht OpenAI Foundation an leas is mó a dhéanamh dóibh.

Is iad ár dtuairimí tosaigh faoi na sonraí ar cheart díriú orthu ná: sonraí nasctha, sonraí ganna agus sonraí díreacha . De ghnáth, beidh ceann nó dhó de na hairíonna seo ag na tacair sonraí a mhaoinímid, a ndéantar cur síos níos mionsonraithe orthu thíos, agus i gcásanna neamhchoitianta beidh na trí airí acu.

Maidir le gach tacar sonraí, creidimid go mbeidh sé níos tábhachtaí de réir a chéile na sonraí a dhéanamh inrochtana go forleathan, agus príobháideachas a chinntiú i gcónaí nuair a bhaineann siad le sonraí othar. Cuirfidh sé sin ar chumas taighdeoirí tógáil ar obair a chéile, agus ligfidh sé don dul chun cinn eolaíoch teacht as áiteanna gan choinne.

1. Sonraí nasctha: An bhitheolaíocht a leanúint thar roinnt céimeanna

   Tagann an bhitheolaíocht chun cinn ar scálaí éagsúla, ach ní léirítear ach cuid amháin den fhírinne i bhformhór thacair sonraí na n-eolaíochtaí beatha. D’fhéadfadh atlas ceall móilíní a thomhas thar na mílte ceall, agus ní leanfadh íomháú aonmhóilín ach aon chill amháin. Tá an dá dhearcadh luachmhar, ach ós rud é go gcruthaítear tacair sonraí den sórt sin go neamhspleách de ghnáth, d’fhéadfadh sé blianta d’obair leantach a thógáil chun a fháil amach cén bhaint atá ag torthaí eolaíochta lena chéile. Is mian linn tacú le foirne taighde aonair bogadh d’aon ghnó idir na scálaí seo agus tacair sonraí shaibhre nasctha a chruthú, a neartaíonn a sraitheanna éagsúla a chéile.

   Mar shampla, cuirfidh ár ndeontas do UCSF ar chumas fhoireann OpenADMET príomh-airíonna agus idirghníomhaíochtaí móilíneacha a thomhas i gcás na mílte comhdhúil. Ansin nascfaidh an fhoireann an phróifíliú leathan seo le dhá léargas ar iompar drugaí: struchtúir phróitéiní iompróra arna gcinneadh go turgnamhach agus móilíní roghnaithe ceangailte leo, agus measúnachtaí a thomhaiseann conas a idirghníomhaíonn na próitéiní seo go feidhmiúil leis na móilíní. Ar deireadh, tástálfaidh siad fo-thacar de na comhdhúile seo i samhlacha de bhacainn fola-inchinne an duine, agus cuirfidh siad na torthaí sin i gcomparáid le tomhais in vivo in ainmhithe.

   Cruthóidh an cur chuige seo maidir le bailiú sonraí cuntas thar a bheith iomlán ar na tosca a chinneann gluaiseacht druga tríd an gcorp—cuntas a chuireann ar chumas samhlacha IS tuartha níos fearr a dhéanamh ar an leibhéal is tábhachtaí dúinne mar dhaoine.

2. Sonraí ganna: An méid nach féidir a athchruthú a shábháil

   Ní féidir le haon IS amach anseo, dá chumasaí é, dul siar agus breathnú ar eachtraí bitheolaíocha a tharla ag tráthanna sonracha uathúla—amhail cúiseanna báis agus drochshláinte i dtíortha nach bhfuil staitisticí iontaofa beatha acu, nó inneachar samplaí bitheolaíocha ó othair ag tráthanna ar leith atá thart anois. Tá go leor deiseanna aonuaire den sórt sin sa bhitheolaíocht, agus d’fhéadfadh samhaltóirí amach anseo úsáidí a bhaint as an bhfianaise sin nach féidir le taighdeoirí a thuar inniu. Dá bhrí sin, tá spéis ar leith againn i dtograí a bhailíonn nó a chaomhnaíonn sonraí luachmhara sula n-imíonn an deis, nó a chuireann tacair sonraí phríobháideacha atá ann cheana agus nach gcruthófar arís go deo ar fáil go forleathan, agus príobháideachas agus toiliú an duine aonair á n-urramú acu.

   Mar shampla, fiosróidh ár ndeontas do CTD Commons an féidir taifid clár forbartha drugaí ar theip orthu a shábháil sula ndúnann cuideachtaí agus sula n-imíonn na taifid sin. Sa ghearrthéarma, d’fhéadfadh na doiciméid seo cabhrú le foirne luathfhorbartha drugaí a thuiscint cad a d’éiligh rialtóirí ó tháirgí comhchosúla, seachas foghlaim trí thriail agus earráid chostasach. San fhadtéarma, d’fhéadfadh na doiciméid a bheith ina n-acmhainní do chórais mheaisínfhoghlama chun patrúin a aimsiú sna cúiseanna a dteipeann nó a n-éiríonn le drugaí, rud a d’fhéadfadh feabhsuithe ar rialáil nó ar straitéisí trialach a spreagadh agus ligean d’othair tairbhe a bhaint as cóireálacha nua níos luaithe.

3. Sonraí díreacha: Na staideanna bitheolaíocha agus cliniciúla is gaire don rud is tábhachtaí a thomhas

   Ar feadh cuid mhór de stair na bitheolaíochta, tomhaiseadh na nithe ab fhusa nó ba shaoire a thomhas. Mar shampla: sonraí ceall aonair a thomhas in ionad sonraí cliniciúla daonna, nó léiriú RNA in ionad próitéiní. Bhí na tomhais ionaid seo thar a bheith úsáideach, ach is féidir leo éirí scartha freisin ó na spriocanna a bhaineann leis an mbitheolaíocht a thuiscint agus galair a chosc agus a chóireáil. I gcásanna den sórt sin, is mian linn na hacmhainní a theastaíonn ó thaighdeoirí a thabhairt dóibh chun tacair sonraí a chur le chéile a thomhaiseann na nithe is tábhachtaí. D’fhéadfadh sé freisin nach bhfuil na huirlisí is gá chun an “fhírinne bhitheolaíoch” a thomhas ann go fóill, nó go bhfuil siad róchostasach le húsáid ar mhórscála. Faoin gclár seo, tá súil againn tacú leis an dá chineál tionscnaimh—sonraí nua agus uirlisí nua.

   Mar shampla, cuirfidh ár ndeontas do UNC chun an Tionscnamh um Imdhíonteiripe Ghiniúnach a bhunú ar chumas na foirne ag UNC Lineberger agus UNC Health na sonraí atá bunaithe ar fhianaise dhaonna a chruthú, sonraí atá riachtanach chun an chéad ghlúin eile de vacsaíní ailse a fheabhsú. Ciallaíonn sé sin próitéiní dhromchla na gceall meall a thomhas go díreach, chomh maith le freagairtí T-cheall na n-othar, seachas “díreach” an meall a sheicheamhú. Tá sé costasach na sonraí seo a chruthú; ach é a dhéanamh go cuimsitheach an uair seo agus na torthaí a chur ar fáil go hoscailte, tá súil againn go mbainfidh gach iarracht amach anseo ar vacsaíní ailse tairbhe astu. Go háirithe, má éiríonn leis an tionscadal seo, beidh iarrthóirí vacsaíne amach anseo in ann dul ar aghaidh chuig dáileoga daonna agus tacar spriocanna níos láidre acu. Ba cheart dó sin an seans go n-oibreoidh siad a fheabhsú, agus cur leis an méid is féidir a fhoghlaim nuair nach n-oibríonn siad.

A chinntiú go bhfuil sonraí inrochtana ag taighdeoirí

Ar deireadh, maidir lenár ndeontais uile, táimid ag cinntiú go mbeidh na tacair sonraí a eascraíonn astu chomh hinrochtana agus is féidir ag taighdeoirí ar fud an domhain.

Ar feadh cuid mhór de stair na heolaíochta, bhí tástáil hipitéisí ar cheann de na príomhbhaic ar fhionnachtana. Ní raibh ach méid áirithe “intleachta” ar fáil chun dul i ngleic le fadhbanna—líon socraithe mac léinn iarchéime agus eolaithe gairmiúla, a chruthaigh sonraí agus a rinne anailís orthu maidir le fadhb. Cuireann dul chun cinn leanúnach IS sa ríomhchlárú agus san anailís sonraí deireadh leis an tuiscint sin. D’fhéadfadh anailís sonraí éirí i bhfad níos inscálaithe, agus léargais ag teacht chun cinn ó chomhoibriú nach furasta a thuar nuair a chruthaítear na sonraí.

Is é ár misean a chinntiú go dtéann an intleacht shaorga ghinearálta chun tairbhe don chine daonna uile. Ba cheart sonraí eolaíochta a chruthaítear lenár dtacaíocht a chur ar fáil go forleathan, agus príobháideachas agus toiliú an duine aonair a chosaint i gcónaí nuair a bhíonn sonraí daonna i gceist. Ach tá níos mó i gceist le hinrochtaineacht ná na sonraí loma a eisiúint. Molaimid d’fhaighteoirí deontais a gcuid anailísí a fhoilsiú mar réamhphriontaí, sonraí a chomhroinnt go rialta seachas ag an deireadh amháin, agus, mura bhfuil sonraí faighteora “nasctha”, oibriú i gcomhar le húsáideoirí na sonraí chun a n-úsáideacht i leith fadhbanna tábhachtacha bitheolaíocha a mheas.

Foghlaim atriallach

Leagtar amach sa phostáil seo ár dtreo tosaigh maidir le Sonraí Poiblí don tSláinte. Táimid ag athbhreithniú ár dtuairimí go gníomhach de réir mar a théann an eolaíocht agus IS chun cinn, agus bunaithe ar chomhráite le daoine eile sa phobal taighde.

Má tá smaointe agat maidir le Sonraí Poiblí don tSláinte, molaimid duit teagmháil a dhéanamh linn ag [email protected]⁠. Is féidir leat liostáil lenár nuachtlitir anseo⁠ chun nuacht a fháil amach anseo faoinár gcláir agus faoinár maoiniú.

Má thaitníonn sé leat smaoineamh go lánaimseartha ar fhadhbanna cosúil leo siúd a pléadh sa phostáil seo, táimid ag earcú faoi láthair do cheithre ról atá ar fáil⁠ ar an bhfoireann Eolaíochtaí Beatha agus Leigheas Galar.